作者:新聞中心來源:時間:2016-11-24 14:45:00
我校教師昝鄉(xiāng)鎮(zhèn)主持申報的項目《基于吸引域變化的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的干預(yù)研究》獲浙江省自然科學基金一般項目立項,。
基因組學研究的一個主要的目的就是如何有效地的干預(yù)系統(tǒng),,使得系統(tǒng)朝人們期望的方向演化,。本研究直接從吸引域結(jié)構(gòu)的改變?nèi)胧郑芯炕蛘{(diào)控網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)干預(yù)的方法和理論,。我們主要開展了以下幾方面的研究:(1)我們在重疊基因降權(quán)(PADOG)方法基礎(chǔ)上提出了一種基于基因重要性和特異性的通路分析方法PAGIS,。實驗結(jié)果表明,PAGIS方法比PADOG能夠提高很多癌癥相關(guān)的排名,,從而提高癌癥相關(guān)通路的識別效果,。此外,我們將基因的重要性和特異性考慮到SPIA方法中并提出SPIA_IS方法,。數(shù)據(jù)結(jié)果表明:我們提出的方法可以識別更多的癌癥相關(guān)通路,;(2)2016年我們提出的基于狀態(tài)域的最優(yōu)干預(yù)算法可以明顯改進算法的時間復(fù)雜度,但是該算法的加過程和減過程非常復(fù)雜,。 我們提出了凈狀態(tài)域(netBOSs)的概念,。根據(jù)受干擾狀態(tài)的先后順序,,可以很簡單的計算出其netBOSs,該方法不僅提高了時間效率,,也簡化了計算過程,。(3)我們提出了一種名為miR_SubPath的新方法,通過三個步驟來鑒定疾病相關(guān)的miRNA,。數(shù)據(jù)結(jié)果顯示,,所提出的miR_SubPath方法比先前的方法更強健并且可以鑒定更多的疾病相關(guān)的miRNA。(4)基于基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的研究成果,,我們將其應(yīng)用到綜合航電系統(tǒng)安全性分析領(lǐng)域,,提出的一種有效的算法可以快速預(yù)測系統(tǒng)安全是否發(fā)生故障,以及發(fā)生故障的條件下如何通過有效的干預(yù),,使得系統(tǒng)盡快恢復(fù)到期望的安全狀態(tài),。